Identificación de enterobacterias multirresistentes a antibióticos en muestras de heces de lactantes residentes en Talara, Piura, Perú / Identification of multidrug-resistant enterobacteriaceae in fecal samples from infants residing in Talara, Piura, Peru Arturo

La colonización fecal en lactantes por bacterias resistentes a los antimicrobianos es un potencial riesgo para futuras terapias antibióticas. Nuestro objetivo fue determinar la frecuencia y características sociodemográficas de lactantes portadores fecales de enterobacterias resistentes a ciprofloxacina (PFRC) y sus genes de resistencia asociados. Analizamos muestras fecales de 41 niños lactantes residentes en el distrito de Talara-Piura, Perú, en 2019. Evaluamos la presencia de 3 genes de resistencia a quinolonas: aac(6')-Ib-cr, qnrB y oqxA y 2 de betalactamasas: bla CTX-M, bla PER-2.El 68% de lactantes fueron PFRC, Escherichia coli (83,3%) fue el más frecuente. El análisis genotípico detectó: oqxA (41,1%), qnrB (26,7%) y aac(6')-Ib-cr (20%) y al gen bla CTX-M en el 93,3% de los aislados con betalactamasas. La elevada frecuencia de PFRC nos alertan sobre el potencial riesgo en la pérdida de utilidad de esta familia antibiótica en el área de estudio.

Fecal colonization by antimicrobial-resistant bacteria in infants is a potential risk for future antibiotic therapy. We aimed to determine the sociodemographic characteristics and frequency of infants who were fecal carriers of ciprofloxacin-resistant enterobacteriaceae (FCCRE) and their associated resistance genes. We analyzed fecal samples from 41 infants from the district of Talara, Piura, Peru in 2019. The presence of 3 quinolone resistance genes was evaluated: aac(6')-Ib-cr, qnrB and oqxA as well as of 2 beta-lactamase genes: bla CTX-M,bla PER-2. We found that 68% of infants were FCCRE, Escherichia coli (83.3%) was the most frequent bacteria. The genotypic analysis detected: oqxA (41.1%), qnrB (26.7%), aac(6')-Ib-cr (20%) and the bla CTX-M gene (93.3%) of the isolates with beta-lactamases. The high frequency of FCCRE alerts us of the potential risk of this antibiotic family becoming less useful over time.

Extended-spectrum ß-lactamases and virulence factors in uropathogenic Escherichia coli in nursing homes in Lima, Peru. / Β-lactamasas de espectro extendido y factores de virulencia en Escherichia coli uropatógenas en asilos de ancianos en Lima, Perú.

Nursing homes are institutions with high prevalence of urinary tract infections caused by ESBL-producing E. coli with several virulence factors. The aim of this study was to determine the frequency of the bla CTX-M gene and eight virulence genes in 35 ESBL-producing uropathogenic E. coli from six nursing homes in Peru during 2018. Of the E. coli samples, 57.1% (20/35) were carriers of the bla CTX-M gene. Furthermore, we obtained frequencies of 46% (15/35) and 37% (13/35) for hly-alpha and cnf-1, respectively; we also found high presence of the iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) and chuA genes (94%, 33/34) as well as a frequency of 46% (16/35) and 91% (32/34) for the pap GII and nanA genes, respectively. The bla CTX-M gene is predominant and a high frequency of exotoxins gives it a competitive advantage for spreading into the bloodstream.

Los asilos de ancianos son instituciones con una alta prevalencia de infecciones del tracto urinario ocasionado por Escherichia coli productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE), con diversos factores de virulencia. El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia del gen bla CTX-M y de ocho genes de virulencia en 35 E. coli uropatógenas productoras de BLEE provenientes de seis asilos en Perú, durante el 2018. El 57,1% (20/35) de las E. coli fueron portadores del gen bla CTX-M. Además, se obtuvo una frecuencia del 46% (15/35) y 37% (13/35) de hly-alfa y cnf-1, respectivamente; elevada presencia de los genes iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) y chuA (94%, 33/34) y una frecuencia del 46% (16/35) y del 91% (32/34) de los genes pap GII y nanA, respectivamente. Existe predominancia en la distribución del gen bla CTX-M, además de una alta frecuencia de exotoxinas que le confieren una ventaja competitiva para diseminarse hacia el torrente sanguíneo.

ß-lactamasas de espectro extendido y factores de virulencia en Escherichia coli uropatógenas en asilos de ancianos en Lima, Perú / ß-lactamases and virulence factors in uropathogenic Escherichia coli in nursing homes in Lima, Peru

RESUMEN Los asilos de ancianos son instituciones con una alta prevalencia de infecciones del tracto urinario ocasionado por Escherichia coli productoras de ß-lactamasas de espectro extendido (BLEE), con diversos factores de virulencia. El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia del gen bla CTX-M y de ocho genes de virulencia en 35 E. coli uropatógenas productoras de BLEE provenientes de seis asilos en Perú, durante el 2018. El 57,1% (20/35) de las E. coli fueron portadores del gen bla CTX-M. Además, se obtuvo una frecuencia del 46% (15/35) y 37% (13/35) de hly-alfa y cnf-1, respectivamente; elevada presencia de los genes iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) y chuA (94%, 33/34) y una frecuencia del 46% (16/35) y del 91% (32/34) de los genes pap GII y nanA, respectivamente. Existe predominancia en la distribución del gen bla CTX-M, además de una alta frecuencia de exotoxinas que le confieren una ventaja competitiva para diseminarse hacia el torrente sanguíneo.

ABSTRACT Nursing homes are institutions with high prevalence of urinary tract infections caused by ESBL-producing E. coli with several virulence factors. The aim of this study was to determine the frequency of the bla CTX-M gene and eight virulence genes in 35 ESBL-producing uropathogenic E. coli from six nursing homes in Peru during 2018. Of the E. coli samples, 57.1% (20/35) were carriers of the bla CTX-M gene. Furthermore, we obtained frequencies of 46% (15/35) and 37% (13/35) for hly-alpha and cnf-1, respectively; we also found high presence of the iucC (63%, 22/35), aer (94%, 33/35) and chuA genes (94%, 33/34) as well as a frequency of 46% (16/35) and 91% (32/34) for the pap GII and nanA genes, respectively. The bla CTX-M gene is predominant and a high frequency of exotoxins gives it a competitive advantage for spreading into the bloodstream.

Identification of multidrug-resistant enterobacteriaceae in fecal samples from infants residing in Talara, Piura, Peru. / Identificación de enterobacterias multirresistentes a antibióticos en muestras de heces de lactantes residentes en Talara, Piura, Perú.

OBJETIVOS.: Motivación para realizar el estudio: Los lactantes, debido al consumo nutricional restringido, capacidad motora limitada y escasa exposición antibiótica, son una población protegida de bacterias multidrogoresistentes. Principales hallazgos: En este estudio, el 68% de los lactantes estuvieron colonizados por bacterias resistentes a quinolonas, siendo E. coli el principal agente causal (83,3%). El principal gen asociado a la resistencia a quinolonas fue oqxA (41,4%,). Asimismo, la mitad de los aislamientos fueron productores de BLEE, y esta resistencia fue causada en el 93,3% de los aislamientos por el gen blaCTX-M. Implicancias: Estos hallazgos nos alertan sobre la alta presencia de bacterias resistentes a antimicrobianos en una población vulnerable, mostrando el potencial riesgo en la pérdida de utilidad de esta familia antibiótica. La colonización fecal en lactantes por bacterias resistentes a los antimicrobianos es un potencial riesgo para futuras terapias antibióticas. Nuestro objetivo fue determinar la frecuencia y características sociodemográficas de lactantes portadores fecales de enterobacterias resistentes a ciprofloxacina (PFRC) y sus genes de resistencia asociados. Analizamos muestras fecales de 41 niños lactantes residentes en el distrito de Talara-Piura, Perú, en 2019. Evaluamos la presencia de 3 genes de resistencia a quinolonas: aac(6')-Ib-cr, qnrB y oqxA y 2 de betalactamasas: blaCTX-M, blaPER-2.El 68% de lactantes fueron PFRC, Escherichia coli (83,3%) fue el más frecuente. El análisis genotípico detectó: oqxA (41,1%), qnrB (26,7%) y aac(6')-Ib-cr (20%) y al gen blaCTX-M en el 93,3% de los aislados con betalactamasas. La elevada frecuencia de PFRC nos alertan sobre el potencial riesgo en la pérdida de utilidad de esta familia antibiótica en el área de estudio.

Immunological and biochemical response of older adults with urinary tract infection to uropathogenic Esherichia coli virulence factors. / Respuesta inmunológica y bioquímica de ancianos con infección urinaria frente factores de virulencia en Escherichia coli uropatógenas.

Descriptive study in which 24 urine samples from older adults with urinary tract infection (UTI), from nursing homes, were evaluated; in order to identify differences in the immune and biochemical response from older adults with UTI by Escherichia coli (E. coli) to major virulence factors in the pathogenesis of UTI. Iron concentration, TNF-α, IL-1ß and antioxidant capacity in urine were determined. A relation was found between, an increase in iron and red blood cell concentration in urine, and the presence of the pap GII gene found in E. coli. It is concluded that older adults, with UTIs by E. coli with the gene pap GII, have increased tissue damage.

Con el objetivo de evidenciar diferencias en la respuesta inmunológica y bioquímica de ancianos con infección del tracto urinario (ITU) por Escherichia coli (E. coli) frente a factores de virulencia de importancia en la patogenia de la ITU, se realizó un estudio descriptivo en el cual se evaluaron 24 muestras de orina de adultos mayores con ITU provenientes de centros de reposo gerontológicos. Se determinó la concentración de hierro, TNF-α, IL-1ß y la capacidad antioxidante en la orina, encontrándose una relación entre una mayor concentración de hierro y de hematíes en la orina con la presencia del gen pap GII en la E. coli. Se concluye que los adultos mayores con ITU por E. coli portadoras del gen pap GII, presentan mayor daño tisular.

Respuesta inmunológica y bioquímica de ancianos con infección urinaria frente factores de virulencia en Escherichia coli uropatógenas / Immunological and biochemical response of older adults with urinary tract infection to uropathogenic Esherichia coli virulence factors

RESUMEN Con el objetivo de evidenciar diferencias en la respuesta inmunológica y bioquímica de ancianos con infección del tracto urinario (ITU) por Escherichia coli (E. coli) frente a factores de virulencia de importancia en la patogenia de la ITU, se realizó un estudio descriptivo en el cual se evaluaron 24 muestras de orina de adultos mayores con ITU provenientes de centros de reposo gerontológicos. Se determinó la concentración de hierro, TNF-α, IL-1β y la capacidad antioxidante en la orina, encontrándose una relación entre una mayor concentración de hierro y de hematíes en la orina con la presencia del gen pap GII en la E. coli. Se concluye que los adultos mayores con ITU por E. coli portadoras del gen pap GII, presentan mayor daño tisular.

ABSTRACT Descriptive study in which 24 urine samples from older adults with urinary tract infection (UTI), from nursing homes, were evaluated; in order to identify differences in the immune and biochemical response from older adults with UTI by Escherichia coli (E. coli) to major virulence factors in the pathogenesis of UTI. Iron concentration, TNF-α, IL-1β and antioxidant capacity in urine were determined. A relation was found between, an increase in iron and red blood cell concentration in urine, and the presence of the pap GII gene found in E. coli. It is concluded that older adults, with UTIs by E. coli with the gene pap GII, have increased tissue damage.

Clasificación filogenética de Escherichia coli uropatógena y respuesta inmunometabólica en adultos mayores con infección urinaria en casas de reposo / Immunometabolic response in older adults with urinary tract infection and phylogenetic classification of Escherichia coli in elderly homes

Objetivos: caracterizar la respuesta inmunometabólica en la orina de pacientes adultos mayores infectados con Escherichia coli uropatógena residentes en casas de reposo y determinar su frecuencia filogenética. Materiales y métodos: estudio observacional descriptivo, en el cual se enrolaron 24 pacientes con infección del tracto urinario y 17 pacientes sin infección del tracto urinario. Se cuantificó el hierro y el TNF ­ α en orina por métodos espectrofotométricos, la capacidad antioxidante por ensayo ABTS+* y la determinación filogenética de E. coli por el método de Clermont. Resultados: la concentración de hierro, TNF ­ α y la capacidad antioxidante en la orina en pacientes con infección del tracto urinario los valores fueron de 175,40 µg/L, 70,11 pg/mL y 1229,75 µg/mL eq-VitC, mientras que en pacientes sin infección fue de 67,4 µg/L (p = 0,001), 87,16 pg/mL (p = 0,08) y 1069,14 µg/mL eq-VitC (p = 0,61) respectivamente. Además, se encontraron 11 E.coli pertenecientes al grupo B2 y 13 agrupados en no - B2 (A, B1, D y E). Conclusiones: se evidencia una alta disponibilidad de hierro en la orina de los pacientes adulto mayores con infección del tracto urinario, lo cual estimula la proliferación bacteriana. Hay una elevada capacidad antioxidante en la orina de los pacientes con infección del tracto urinario y una mayor presencia clonal de E.coli de tipo no B2 en la orina de los pacientes residentes en casas de reposo..(AU)

Objectives: to characterize the immunometabolic response in the urine of elderly patients infected with uropathogenic Escherichia coli resident in elderly homes and determine its phylogenetic frequency. Materials and methods: descriptive and observational study in which 24 patients with urinary tract infection and 17 patients without urinary tract infection were enrolled. Were quantified Iron and TNF ­ α in urine by spectrophotometric methods, the antioxidant capacity by ABTS + * assay and the phylogenetic determination of E. coli by the Clermont method. Results: the concentration of iron, TNF - α and the antioxidant capacity in urine in patients with urinary tract infection were 175.40 µg / L, 70.11 pg / mL and 1229.75 µg / mL eq-VitC, while in patients without infection the values were of 67.4 µg / L (p = 0.001), 87.16 pg / mL (p = 0.08) and 1069.14 µg / mL eq-VitC (p = 0.61) respectively. In addition, 11 E. coli belonging to group B2 and 13 grouped in non - B2 (A, B1, D and E) were found. Conclusions: high availability of iron in the urine of elderly patients with urinary tract infection is evidenced, which stimulates bacterial proliferation. There is a high antioxidant capacity in the urine of patients with urinary tract infection and a greater clonal presence of non-B2 type E.coli in the urine of patients residing in elderly homes..(AU)

Diseño de un enzimo-inmunoensayo (dot-ELISA) en membrana de nitrocelulosa, tipo sandwich para la detección de coproantígenos contra diferentes especies de Campylobacter en heces humanas / Design of immunoenzyme techniques (dot-ELISA) in membrane of nitrocellulose, type sandwich for the detection of coproantígens against different species from Campylobacter in human feces

La campilobacteriosis constituye una de las enfermedades diarreicas más frecuentes en el hombre, causada principalmente por consumo de alimentos. El diagnóstico tradicional, ampliamente utilizado, es el cultivo microbiológico, el cual necesita de al menos 48 horas para poder ser reportado, además de necesitar de ciertas condiciones especiales de cultivo. Actualmente existen diferentes pruebas diagnosticas para la detección de Cempytobecter spp, como los ensayos inmunoenzimáticos tipo ELlSA y pruebas más sofisticadas como la “Polymerase Chain Reaction” (PCR) (24, 25, 26, 27). El test de dot-ELlSA es una prueba inmunoenzimática que hasta el momento no ha sido adaptada para el diagnóstico de Campylobacter spp, considerándosele una buena alternativa para su uso debido al poco requerimiento de insumos para su aplicación, especialmente en laboratorios que no cuentan con la infraestructura necesaria para realizar un cultivo de Campylobacter spp o estudios de ELlSA. El trabajo, desarrollado constituyó el diseño de un dot-ELlSA para la detección de coproantígenos de Campylobacter en heces humanas, estableciendo la sensibilidad analítica y la sensibilidad y especificidad epidemiológica del ensayo. Para esto se utilizó muestras de pacientes del Instituto Nacional del Niño (INSN), en el periodo de Marzo-Agosto 2010. El presente estudio es de tipo descriptivo, observacional y de corte transversal. El criterio de muestreo utilizado fue por conveniencia, terminando el proceso de recolección al momento de finalizar el número de muestras preestablecidas. El análisis de datos se llevo a cabo mediante el uso de la tabla 2 x 2. Se analizó un total de 72 muestras, diez muestras positivas al cultivo de Campylobacter spp (13.89 por ciento), 12 muestras con diagnostico microbiológico para otros enteropatógenos bacterianos (16.67 por ciento), y 50 muestras con cultivo microbiológico negativo para cualquier entero patógeno bacteriano (69.44 por ciento). La sensibilidad analítica del ensayo fue de aproximadamente 332.3ng/ml, con una sensibilidad diagnóstica del 100 por ciento Y especificidad del 95.16 por ciento. En el se estudio se concluye que el ensayo dot-ELlSA no debe sustituir el cultivo microbiológico, sin embargo constituye una técnica alternativa con alta sensibilidad y especificidad para el diagnostico rápido de campilobacteriosis (150 minutos). Futuros estudios son necesarios para colectar mayor información relacionada con la detección de coproantígenos de Campylobacter, recomendándose el análisis de un mayor número de muestras y el análisis de un mejor gold están dar como prueba de referencia debido a la menor sensibilidad del cultivo con respecto a pruebas más sofisticadas como el PCR

Diseño de un enzimo-inmunoensayo (dot-ELISA), en membrana de nitrocelulosa, tipo sandwich para la detección de coproantígenos contra diferentes especies de Campylobacter en Heces humanas / Design of an enzimo-inmunoensayo (dot-ELISA), in membrana of nitrocelulosa, type sandwich for the detection of coproantígenos against Campylobacter's different species in human Dregs

La campilobacteriosis constituye una de las enfermedades diarreicas más frecuentes en el hombre, causada principalmente por consumo de alimentos. El diagnóstico tradicional, ampliamente utilizado, es el cultivo microbiológico, el cual necesita de al menos 48 horas para poder ser reportado, además de necesitar de ciertas condiciones especiales de cultivo. Actualmente existen diferentes pruebas diagnósticas para la detección de campylobacter spp, como los ensayos inmunoenzimáticos tipo ELISA y pruebas más sofisticadas como la "Polymerase Chain Reaction(PCR). El test de dot-ELISA es una prueba inmunoenzimática que hasta el momento no ha sido adaptada par el diagnóstico de Campylobacter en heces humanas, estableciendo la sensibilidad analítica y la sensibilidad y especificidad epidemiológica del ensayo. Para eso se utilizó muestras de pacientes del Instituto Nacional del Niño (INSN), en el periodo de Marzo-Agosto 2010. El presente estudio es de tipo descriptivo, observacional y de corte transversal. El criterio de muestreo utilizado fue por conveniencia, terminando el proceso de recolección al momento de finalizar el número de muestras preestablecidas...